Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ssr4Q62186 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssr4Q62186 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms