Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sin3bQ62141 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms