Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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