Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Odf1Q61999 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Odf1Q61999 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Odf1Q61999 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Odf1Q61999 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Odf1Q61999 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Odf1Q61999 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Odf1Q61999 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Odf1Q61999 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Odf1Q61999 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Odf1Q61999 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Odf1Q61999 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Odf1Q61999 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Odf1Q61999 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Odf1Q61999 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Odf1Q61999 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Odf1Q61999 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Odf1Q61999 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Odf1Q61999 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Odf1Q61999 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Odf1Q61999 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Odf1Q61999 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
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Odf1Q61999 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Odf1Q61999 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Odf1Q61999 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Odf1Q61999 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Odf1Q61999 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Odf1Q61999 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Odf1Q61999 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Odf1Q61999 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Odf1Q61999 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Odf1Q61999 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Odf1Q61999 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Odf1Q61999 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Odf1Q61999 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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