Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rai1Q61818 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rai1Q61818 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rai1Q61818 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rai1Q61818 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rai1Q61818 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rai1Q61818 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rai1Q61818 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rai1Q61818 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rai1Q61818 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rai1Q61818 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rai1Q61818 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rai1Q61818 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rai1Q61818 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rai1Q61818 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rai1Q61818 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rai1Q61818 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai1Q61818 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai1Q61818 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai1Q61818 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rai1Q61818 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms