Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cd47Q61735 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cd47Q61735 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms