Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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AtrxQ61687 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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AtrxQ61687 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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AtrxQ61687 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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AtrxQ61687 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AtrxQ61687 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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AtrxQ61687 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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AtrxQ61687 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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