Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itm2aQ61500 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms