Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msi1Q61474 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms