Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
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PcolceQ61398 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PcolceQ61398 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
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PcolceQ61398 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PcolceQ61398 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PcolceQ61398 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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PcolceQ61398 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PcolceQ61398 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcolceQ61398 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcolceQ61398 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcolceQ61398 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcolceQ61398 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcolceQ61398 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcolceQ61398 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcolceQ61398 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcolceQ61398 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcolceQ61398 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcolceQ61398 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcolceQ61398 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcolceQ61398 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcolceQ61398 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PcolceQ61398 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PcolceQ61398 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PcolceQ61398 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PcolceQ61398 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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