Protein–RNA interactions for Protein: Q61127

Nab2, NGFI-A-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab2Q61127 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nab2Q61127 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms