Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usf1Q61069 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usf1Q61069 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usf1Q61069 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usf1Q61069 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usf1Q61069 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usf1Q61069 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf1Q61069 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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