Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JrkQ60976 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
JrkQ60976 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JrkQ60976 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JrkQ60976 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
JrkQ60976 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms