Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp4Q60972 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms