Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a1Q60714 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a1Q60714 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a1Q60714 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a1Q60714 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a1Q60714 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a1Q60714 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a1Q60714 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a1Q60714 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a1Q60714 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a1Q60714 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a1Q60714 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc27a1Q60714 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc27a1Q60714 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms