Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ItgaeQ60677 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgaeQ60677 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms