Protein–RNA interactions for Protein: Q60665

Skil, Ski-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkilQ60665 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SkilQ60665 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SkilQ60665 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SkilQ60665 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SkilQ60665 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SkilQ60665 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SkilQ60665 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SkilQ60665 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms