Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms