Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Utp20Q5XG71 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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