Protein–RNA interactions for Protein: Q5U406

Zfp78, Zinc finger protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp78Q5U406 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp78Q5U406 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms