Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sft2d1Q5SSN7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sft2d1Q5SSN7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms