Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Utp18Q5SSI6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Utp18Q5SSI6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms