Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85aQ5SP85 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85aQ5SP85 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms