Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna2d4Q5RJF7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna2d4Q5RJF7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna2d4Q5RJF7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna2d4Q5RJF7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna2d4Q5RJF7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna2d4Q5RJF7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna2d4Q5RJF7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna2d4Q5RJF7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna2d4Q5RJF7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna2d4Q5RJF7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna2d4Q5RJF7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna2d4Q5RJF7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna2d4Q5RJF7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna2d4Q5RJF7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna2d4Q5RJF7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna2d4Q5RJF7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms