Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms