Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc1Q5NCF2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms