Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim41Q5NCC3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms