Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC83

Spata48, Spermatogenesis-associated protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata48Q5NC83 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata48Q5NC83 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata48Q5NC83 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata48Q5NC83 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata48Q5NC83 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata48Q5NC83 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata48Q5NC83 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spata48Q5NC83 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms