Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm12253Q5NC48 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm12253Q5NC48 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm12253Q5NC48 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm12253Q5NC48 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm12253Q5NC48 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm12253Q5NC48 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm12253Q5NC48 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm12253Q5NC48 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm12253Q5NC48 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm12253Q5NC48 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm12253Q5NC48 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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