Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afap1l2Q5DTU0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms