Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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