Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f8Q58FA4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f8Q58FA4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f8Q58FA4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f8Q58FA4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f8Q58FA4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f8Q58FA4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f8Q58FA4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f8Q58FA4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f8Q58FA4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f8Q58FA4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f8Q58FA4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f8Q58FA4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f8Q58FA4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f8Q58FA4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f8Q58FA4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f8Q58FA4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f8Q58FA4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f8Q58FA4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f8Q58FA4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f8Q58FA4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f8Q58FA4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f8Q58FA4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
E2f8Q58FA4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms