Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spag9Q58A65 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spag9Q58A65 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms