Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WhammQ571B6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms