Protein–RNA interactions for Protein: Q56A07

Scn2b, Sodium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2bQ56A07 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn2bQ56A07 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn2bQ56A07 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms