Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms