Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms