Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ankrd28Q505D1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms