Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms