Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox3aQ4TU90 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox3aQ4TU90 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms