Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a5Q4LDG0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms