Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trappc3lQ4KL14 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms