Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syne3Q4FZC9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syne3Q4FZC9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syne3Q4FZC9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syne3Q4FZC9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syne3Q4FZC9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms