Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Esf1Q3V1V3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Esf1Q3V1V3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Esf1Q3V1V3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Esf1Q3V1V3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Esf1Q3V1V3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Esf1Q3V1V3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Esf1Q3V1V3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Esf1Q3V1V3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Esf1Q3V1V3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Esf1Q3V1V3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Esf1Q3V1V3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Esf1Q3V1V3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Esf1Q3V1V3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Esf1Q3V1V3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Esf1Q3V1V3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Esf1Q3V1V3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Esf1Q3V1V3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Esf1Q3V1V3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Esf1Q3V1V3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Esf1Q3V1V3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Esf1Q3V1V3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Esf1Q3V1V3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Esf1Q3V1V3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms