Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ulk4Q3V129 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms