Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc110Q3V125 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms