Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cldn34b4Q3V0X2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cldn34b4Q3V0X2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cldn34b4Q3V0X2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cldn34b4Q3V0X2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cldn34b4Q3V0X2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cldn34b4Q3V0X2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cldn34b4Q3V0X2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cldn34b4Q3V0X2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34b4Q3V0X2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms