Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Lrrc43Q3V0L5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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