Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Garnl3Q3V0G7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms