Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWQ3

Ube2fb, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F-B, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fbQ3UWQ3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2fbQ3UWQ3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms